同样是菌肥，有的价格高，有的价格低，高的能达到100多元一袋，低的五六十元就可以买到。于是果农们糊涂了，宁愿买价格低的菌肥，不愿意买价格高的。
决定菌肥价格的要素一是有机质，二是有益菌。
有机质来源于有机肥，有机肥来源于有机物，有机物不同，有机肥价格也就不同。可以做有机肥的有机物原料很多，城市污泥、风化煤、湖泊沉积物、秸秆、豆粕、畜禽粪便、粮食下脚料等都可以是做有机肥的原料。原料不同，成本不同，自然有机肥的价格也就不同。另外，生物有机肥中的有机物，还必须能够满足有益菌的生存。相比较来说，在风化煤中添加有益菌，菌种的存活与繁殖就没有在畜禽粪便好。
有益菌不是一种物质，而是自然界的一大类。不同的生物菌其保存、扩繁需要的条件不同，也造成有益菌价位的不同。比如促进发酵的一类菌，在自然界很好存活，扩繁也相对简单。而木霉菌、多粘类芽孢杆菌等菌种，对生产工艺、生产设备要求较高，因而成本大，价格贵。
总之，购买生物菌肥，一定不能只看价格，要看有机物的原料，还要看有益菌的生产难易程度。
另外，有的菌肥本身并没有特别添加菌种，而是在有机物发酵过程中自然存在的菌种，但有的也把这种肥料称为生物有机肥。大家可以在购买肥料时，看一看执行标准号，凡是使用525标示的就是有机肥，而不是生物有机肥。
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