据财政部官网消息，中央财政2016年拨付专项资金338亿元用于治理水、土、气。
在水污染防治方面，2016年，中央财政共拨付专项资金131亿元，对纳入中央储备库的重点流域水污染防治等项目予以支持。
土壤污染防治，也是中央财政支持的重点。2016年，根据国务院印发的《土壤污染防治行动计划》，中央财政整合原重金属污染防治专项等设立土壤污染防治专项资金，当年拨付专项资金95亿元，重点支持38个重金属污染重点防控区域治理示范延续工作;支持各省负责统筹用于土壤污染风险管控、监测评估、监督管理、污染土壤修复与治理等;支持土壤污染状况详查工作。
根据《大气污染防治行动计划》，从2013年开始，中央财政设立大气污染防治专项资金，“十二五”期间共安排254亿元，支持京津冀及周边、长三角、珠三角治理雾霾。2016年下达专项资金112亿元，支持京津冀、长三角、珠三角等重点区域落实“大气十条”。同时，建立专项资金绩效评价制度，将资金安排与环境质量改善绩效考核结果挂钩。
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